沙眼衣原體易侵犯柱狀上皮細胞如尿道、子宮頸內膜、子宮內膜、輸卵管皺襞上皮、眼、鼻咽及直腸黏膜并引起病變，不侵犯陰道扁平上皮，故感染后僅寄生于陰道但不引起陰道炎。一般急性感染時機體反應輕微常無癥狀而臨床無急性期。除衣原體本身引起病變外，機體免疫反應亦參與發(fā)病，衣原體膜上的LPS可誘發(fā)機體免疫反應，其代謝產物亦可引起機體的變態(tài)反應，但由于病原體寄生于細胞內可逃避免疫防衛(wèi)作用。病原體在細胞內持續(xù)感染及繁殖，并不斷感染新的細胞，造成*內反復持續(xù)感染。急性感染時局部主要是中性多核細胞反應，慢性或再感染則引起單核細胞反應。長期反復的炎癥病變，加之機體的免疫反應，可導致瘢痕形成。沙眼衣原體常附在病人眼的分泌物中，任何與此分泌物接觸的情況，均可造成沙眼傳播感染的機會。

因此，應加強宣傳教育，把防治眼病的知識傳給群眾，貫徹預防為主的方針。培養(yǎng)良好衛(wèi)生習慣。不用手揉眼，毛巾、手帕要勤洗、曬干;托兒所、學校、工廠等集體單位應分盆分巾或流水洗臉，對沙眼病人應積極治療，加強理發(fā)室、浴室、旅館等服務行業(yè)的衛(wèi)生管理，嚴格毛巾、臉盆等消毒制度，并注意水源清潔。