多數(shù)生殖器疣患者沒有明顯的癥狀，少數(shù)可有瘙癢、灼熱、疼痛、出血。部分女性生殖器疣患者可有陰道不適感，這可能主要是因?yàn)楹喜⒓?xì)菌性、真菌性或滴蟲性陰道炎的緣故。該病潛伏期3周至8個月，平均3個月。男性多發(fā)生在冠狀溝、龜頭、包皮系帶，其次為尿道口、陰莖、陰囊，肥胖者常累及臀間隙，同性戀者常發(fā)生于肛周和直腸；*者可發(fā)生于口腔黏膜。女性主要好發(fā)于大小陰唇、陰蒂、陰道和宮頸，至少20%的女性患者會累及會陰和肛周。一般生殖器疣�？稍谝惶幓蚨嗵幊霈F(xiàn)數(shù)個皮損，少單發(fā)。有報(bào)道生殖器疣可自然消退，消退后仍有45%的患者存在潛伏感染，其中67%可再復(fù)發(fā)。

國外一般將生殖器疣的臨床表現(xiàn)分為4種類型：①尖銳濕疣（condylomataaccuminata），皮損呈菜花狀、乳頭狀或雞冠狀外觀，是生殖器疣的經(jīng)典型，好發(fā)于包皮系帶、肛周、陰唇、陰道等潮濕部位，生長多較快；②丘疹型疣（papularwart），為肉色、直徑1～4mm的圓頂丘疹，多位于相對干燥的部位，如陰莖、大陰唇外側(cè)；③角化型疣（keratoticwart），系角化型丘疹，表面粗糙，有時和尋常疣或脂溢性角化類似，①和③均屬于外生性生殖器疣；④扁平型生殖器疣（flatcondylomata），直譯為“扁平型濕疣”，皮損為斑疹或稍隆起皮面呈斑丘疹。目前國內(nèi)對生殖器疣沒有進(jìn)行明確的分型，均統(tǒng)稱為“尖銳濕疣”，而確切來說，尖銳濕疣是生殖器疣的一種臨床類型，兩者并不等同。

兒童生殖器疣與成人的區(qū)別在于：①男童以肛周CA最為常見，在成年男性好發(fā)的外生殖器部位則很少見。女童發(fā)病部位與成年女性無明顯差異；②除生殖器、肛周外，有的患兒在臀部、腹股溝、大腿、頸、耳及手足等亦有不同程度的受累，且HPV分型與生殖器區(qū)域相同，因此，有些學(xué)者認(rèn)為兒童生殖器疣是從其他部位自體接種到生殖器部位的。兒童生殖器疣多為尖銳濕疣，直徑2～10mm，偶有兒童巨大尖銳濕疣的報(bào)道，有些呈扁平型生殖器疣，可以部分融合。

臨床上還有一種巨大型尖銳濕疣，又稱為“Buschke-Lowenstein”巨大型尖銳濕疣，是黏膜色或淡紅色扁平狀菜花樣腫瘤，可發(fā)生于龜頭、包皮、女陰和肛門，皮損巨大，可形成潰瘍，侵入較深組織，該病具有可惡變發(fā)展為流狀癌和復(fù)發(fā)的特性，但一般不發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移，多由HPV6感染引起。