比較淺的ⅡL型肛瘺，從外向向里挖除，結扎內(nèi)口。挖除部的瘺管，留置引流。

ⅡH型肛瘺，從內(nèi)口向上方行走的瘺管，做盡可能的徹底挖除，之后掛線。要徹底地切除，切開瘺管是不可能的，并且危險很大。挖除后在一般情況下，不做處理也可以自然痊愈。從內(nèi)口到原發(fā)病灶，因切除而造成的創(chuàng)面可以用來引流。

ⅢU型肛瘺，從主內(nèi)口挖到主瘺管，在肛門內(nèi)縫合閉鎖。處理原發(fā)病灶，因切除而造成的創(chuàng)面可以用來引流。

ⅢB肛瘺，從主內(nèi)口挖到主瘺管，在肛門內(nèi)縫合閉鎖，處理原發(fā)病灶，從外肛門括約肌間隙一直進入到Courtney’s space之后切除，開放引流。支瘺管根據(jù)必要性切除或開放。

Ⅳ型肛瘺和Ⅲ型肛瘺進行同樣手術方法，這型肛瘺的特點是，開放骶骨前方瘺管會自然形成開放引流作用。

在做Ⅳ型肛瘺手術之前，首先要作明確診斷，為確診Ⅳ型肛瘺的有效檢查方法有：直腸指診、肛門B超、MRI圖像檢查。MRI檢查出的Ⅳ型肛瘺確診率，單側達83%，雙側78%。

Ⅳ型肛瘺的原發(fā)病灶位置，如果在提肛肌上較高的情況下，藥充分地開放骶骨膿腔，必要時切開尾骨，極少病例必要時切開下部骶骨，確認膿腔進行開放引流。主瘺管特別深的病例也要進行徹底切除，之后在肛門內(nèi)縫合閉鎖。此型肛瘺癌變的可能性較大，一定要送病理組織學檢查。歐美所做的flap advancement repair，會很傷害直腸壁，另外會造成直腸黏膜脫垂，我們不采用這種方法。原則上進行單純縫合閉鎖，形成引流。原發(fā)病灶切除后，在組織缺損特大的情況下，用臀大肌代替補充。

也有直腸穿孔的病例，以前對直腸穿孔病例。造臨時造口，但現(xiàn)在完全不采用這個方法。改進為高能量輸液、限制飲食、阻止排便。